⑴分类整改。对重大项目跟踪审计发现的问题实行边审边改；对由于历史遗留等客观原因不能短期整改的，由被审计单位说明情况并提交详实的整改方案，逐步整改；对固定资产投资审减率超过20%的项目并给国家造成直接损失、重大影响的建设单位，将移交监察机关严肃追究问责。⑵联动督查。将整改不及时、整改不到位、整改不报告的被审计单位纳入重点评议单位；督查部门坚持每年牵头开展2次审计整改专项督查，财政、发改等部门把审计整改情况作为重大投资项目安排、财政收支预算安排等工作的重要依据，纪检监察等部门对审计移送的事项严肃问责问效。⑶严格考核。将审计整改落实情况纳入年终目标绩效考核，对审计发现问题整改落实不到位的单位实行倒扣分制，并约谈被审计单位主要负责人；整改结果同时作为组织部门评价领导干部履行经济责任、考察任用干部的参考依据。